Under 300-talet är Alexandria i Egypten hemvist för det legendariska biblioteket, ett säte för kunskap och lärande utan jämförelse i den antika världen. Filosofen Hypatia brinner för vetenskapen och är på väg att avslöja mysteriet kring solsystemet, århundraden före Copernicus och Galileo. Men hennes arbete hotas av kristendomens framväxt och konflikter mellan kristna och hedningar...