Den tidligere CIA-agenten Jason Bourne blir tvunget ut i dagslyset igjen etter syv år på flukt. Etter hvert som minnene om hvem han egentlig er har blitt klarere, ønsker han å finne de siste bitene av puslespillet. Samtidig endrer verden seg i et tempo som løper i fra makten. De kan bare se på at en ny virkelighet legger seg som et rutenett oppå den gamle. Å huske alt er ikke det samme som å vite noe.