Animatrix on arvostetuimpien anime-ohjaajien luoma yhdistelmä tietokoneanimaatiota ja japanilaista animea. Lyhytelokuvat kertovat ajasta ennen Matrixin tapahtumia, ihmiskunnan viimeisistä kaupungeista, sodasta koneita vastaan ja ihmissuvun kukistumisesta.