Efter at have mistet sin hustru syv år tidligere, holder den excentriske dr. John Dolittle, den berømte læge og dyrlæge i dronning Victorias England, sig bag de høje mure på Dolittle Manor med kun sine eksotiske dyr som selskab. Men da den unge dronning bliver alvorligt syg, begiver Dolittle sig modvilligt ud på et episk eventyr til en mystisk ø på jagt efter en kur.