Batman: The Doom That Came to Gotham är en berättelse som utspelar sig på 1920-talet där upptäcktsresanden Bruce Wayne av misstag släpper lös en uråldrig ondska, vilket leder honom tillbaka till Gotham City efter två decenniers frånvaro. Den logiskt och vetenskapligt inriktade Batman måste kämpa mot Lovecraftianska övernaturliga krafter som hotar Gothams existens.