Sexåriga Hushpuppy bor med sin lynniga pappa i en sliten by i den amerikanska södern. Hon får oftast sköta sig själv och ser världen runt omkring som ett ömtåligt nät av levande varelser, där hela universums existens är beroende av att alla delar passar ihop. Men en dag rubbas ordningen, byn översvämmas och hennes pappa blir allvarligt sjuk. Det blir den lilla hjältinnnan som får försöka klara av den stora katastrofen.