Under en tornado i vannet sør for Boston blir Joe Randall fascinert av det uvanlige været, men innser snart at det ikke er en vanlig storm. Når tornadoen går innover i landet er plutselig innbyggerne i Boston fanget midt i en dødelig storm. Når byen er beleiret innser Joe, søsteren hans Maddy og hans gamle kollega Lee at de har å gjøre med et værfenomen man aldri har sett før som kalles Stonados.