Seks år gamle Hushpuppy bor med sin temperamentsfulle far i et fattigslig kystsamfunn i det sørlige delen av USA. Hun må som oftest ta vare på seg selv og ser verden rundt omkring seg som et skrøpelig nett av levende vesener, der hele universets eksistens er avhengig av at alle deler passer sammen. Men en dag forstyrres ordningen, landsbyen oversvømmes og faren hennes blir alvorlig syk. Det blir den lille heltinnen som må forsøke å håndtere den store katastrofen.