On vuosi 1855, ja aiemmin eristäytynyt Japani on suuren muutoksen edessä. Amerikkalaisten imperialistien uhatessa lääninherra julistaa juoksukilpailun saadakseen samurainsa kuntoon. Samurai Marathon 1855 perustuu todelliseen kilpailuun, joka tunnetaan Japanissa nimellä Ansei Tooashi ja josta on tullut perinne. Elokuva on eeppinen kertomus urhoollisuudesta ja valtataistelusta.